
“苏芯一号”猪抗病育种芯片
扬州网讯(通讯员 杨进 记者 陈源浩)听说过手机芯片,但你听说过“猪芯片”吗?日前,扬州大学动物科学与技术学院包文斌教授团队成功研发“苏芯一号”猪抗病育种芯片,并在生产育种中正式推广应用。该款芯片涵盖了与仔猪腹泻、圆环病毒病、流感等多种疾病抗性,以及一般抗病力、繁殖性能等性状相关的SNPs(单核苷酸多态性)和Indels(插入或缺失),为我国生猪遗传改良,尤其是抗病性状的改良提供了高效工具。
据悉,“苏芯一号”猪抗病育种芯片包含243个功能位点,基于团队多年在猪抗病基因挖掘及分子遗传标记开发领域的研究积累,并结合了猪重要经济性状功能基因相关研究报道。团队克服了当前猪抗性表型不易度量及抗性群体缺乏,难以通过全基因组关联分析策略有效筛选抗性相关SNPs位点等瓶颈,通过大规模平行报告分析(MPRA)、先导编辑及基因功能验证等技术手段,鉴定出一批影响猪抗病和繁殖性能的遗传变异位点。
芯片设计依托我国地方猪品种和商业猪品种基因组测序数据,经严格筛选获得覆盖全基因组的高质量变异位点,并采用北京康普森农业科技有限公司研发的CAGT靶向捕获测序技术进行靶位点捕获。该芯片聚焦猪重要疾病抗性育种,是对现有商业化育种芯片的有效补充,可弥补商业化芯片在疾病抗性位点覆盖上的不足,使生猪育种实现优质高产和抗病的多性状平衡选育。
“苏芯一号”猪抗病育种芯片具有高效、精准与低成本的优势,可在个体早期快速识别疾病抗性优良基因,缩短育种周期、提高选育准确性。该芯片将在提升种猪健康养殖水平、推动生猪产业高质量发展等方面发挥重要作用。
市农业农村局相关负责人表示,下一步,将立足生猪产业实际需求,依托“苏芯一号”等创新成果,助力扬州生猪良种繁育与畜牧产业高质量发展。